清凉月老师的学科体系以东方传统文化实证研究为基础，融合现代科学思维，构建了独特的理论框架与实践方法论。

其核心内容可概括如下：

一、学科定位与基础‌儒释道实证融合‌ 以佛学实证突破为核心，整合道家修炼体系与儒家心性学说，通过科学研究的手段，形成贯通性实证理论‌。

依托传统气功、中医基础，结合现代心理学和物理学研究成果，建立跨维度实证架构‌。‌

科学化理论建构‌ 提出“科学实证”方法论，通过《思维现象基础研究》等著作，将传统修行经验转化为可验证的现代学科体系‌。强调对思维本质、物质形态、时间概念等基础命题的系统解构‌。

二、核心理论框架‌ 区分“现象”与“本质”认知路径，主张通过实证突破感官局限：‌

现象层‌：采用西方科学分析法研究物质形态特征‌本质层‌：

运用东方实证法探索意识本源‌‌思维状态演变论‌ 揭示从“如来藏”到“当前思维状态”的演化规律，提出通过实证回归根本意识状态（即“唯我独尊”境界）的转化路径‌。

建立包括散乱、专注、昏沉等思维状态的分析方法。

三、方法论创新‌实证技术体系‌ 开发“跟的思想”“选择性思维调控”等实践方法，系统解决传统修行中的境界退失问题‌。

结合现代作息规律研究，形成可量化的实证进度评估标准‌。

四、课程架构设置14节理论课程，

涵盖：实证学基础原理‌心物一体认知‌时间本质解构‌不同维度时空转换方法‌通过《科学实证》等教材，将传统修行转化为包含“条件论”“方法论”“结果验证”的完整教学系统‌.